（1）芝麻贮藏芝麻籽粒较小，含油量高，加之除杂较难，极易吸湿发热，酸败变质。因此，贮藏芝麻应严格控制水、杂含量。实践证明，散装芝麻水分在7．5％以下，杂质不超过1％，一般可以安全贮藏。水分在7．5％～8％，虽在冬季，也只能短期贮藏。水分、杂质含量在安全标准以内的芝麻，以采取散装密闭为宜。密闭贮藏的芝麻，品质变化很小，出油率比通风贮藏的芝麻为高。
（2）芝麻油的贮藏芝麻油中含有芝麻酚、生育酚等天然抗氧化剂，与一般油脂相比不易氧化酸败。但天然抗氧化剂在加工过程中容易受热而被破坏，所以在贮藏期间仍需加强管理。入库贮藏时，水、杂均不得超过0．2％，酸价不超过4～5。其贮藏方法与大豆油相似。
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