1、炭疽病：选择土层深厚，排水良好的沙质壤土栽培。2、角斑病：加强苗期管理，套种豆科植物。3、灰色膏药病：调整林木密度，对病老株合理修剪，去掉病老枝。4、绿尾大蚕蛾：应避免与其他林木药材混栽，在成虫发生期使用黑光灯诱杀。5、大蓑蛾：人工摘除虫囊。6、山茱萸蛀果蛾：及时清除早期落果。
一、炭疽病
1、危害特征
炭疽病又名黑斑病、黑果病、黑疤痢。幼果发病（果炭蛆）多从果顶侵入，病斑从果顶向下扩展，病部黑色，边缘红褐色，病斑逐渐扩展到全果，果实黑干收缩，多不脱落。成果发病，病斑最初是棕红色的小点，病斑逐渐扩大成圆形或椭圆形的黑色凹陷病斑，病斑边缘是红褐色，外围有红色的晕圈。病原菌侵害叶片（叶炭蛆），最初是红褐色的小点，之后扩展成褐色的圆形病斑，直径约为1~4毫米，病斑边缘为红褐色，周围有褪色的晕圈，病斑经常穿孔脱落。果炭疽病发病盛期为6~8月，叶炭疽病发病盛期为5~6月。
2、防治办法
选用土层深、排水良好的沙质壤土种植，不可过密，加强管理，病期少施氮肥多施磷钾肥，促进植株健壮，提高植株抗病能力，减轻危害。清除落叶、病僵果深埋或烧毁，减少感染源。发病初期用1：2：200波尔多液喷洒。
二、角斑病
1、危害特征
角斑病主要危害叶片和果实。叶片发病，初期叶正面出现暗紫红色小斑点，病斑边缘不明显，只有表皮细胞变色，叶片背面无症状，果实发病，锈褐色圆形小点，直径1毫米左右，病斑数量多时，连接成片，使果顶部呈锈褐色，只侵害果皮，病斑不深入果肉。从5月发病，一直危害到10月末，7月是发病高峰。
2、防治方法
加强苗期管理，套种豆科植物，减少壮株，去除病叶，通风透光，减少侵染病源，增加磷钾肥和农家肥料，提高植物抗病能力，5月份树冠喷洒1：2：200波尔多液保护剂，每10~15天1次，连续3次，或者喷50%可湿性退菌特800~1000倍液。
三、灰色膏药病
1、危害特征
灰色膏药病一般发生在20年以上的老树树干或枝条上，病斑贴在枝干上形成不规则的厚膜，像膏药一样，所以被称为膏药病。土壤贫瘠、排水不良、土壤湿度大、通风透光性差、植物生长弱时发病严重。
2、防治方法
加强养护管理，调整林木密度，密度过大的要进行去弱留壮，去小留大，用来调节光照条件，提高植物的抗病能力，合理修剪病老植物，去除病老树枝，更新植株，保留内膛发出的生长枝，逐渐更换病重枝干，减少病原来源，用刀刮菌丝膜，在病部涂波美5度石硫合剂或石灰乳，在伴生病菌的介壳虫发生期树冠喷洒敌敌畏乳油1000倍液防治，发病初期喷1：1：100的波尔多液保护，每隔10~14天1次，连续多次。
四、绿尾大蚕蛾
1、危害特征
绿尾大蚕蛾又称水青蛾、燕尾蛾、大青虫。幼虫取食叶片，引起半透明的斑点、孔洞和缺刻，严重时可以把全叶吃光，高龄幼虫还可以吃叶柄，对山茱萸药树的正常生长、药材产量和质量有很大影响。通常发生在5月中旬~10月上旬。
2、防治方法
山茱萸药树应避免与枫杨、榆树、核桃、杜仲、牡丹、芍药等其他林木药材混合栽培，有利于管理和预防，在成虫发生期间，用黑光灯诱杀，发病初期可用90%晶体敌百虫800倍液喷雾，产卵盛期人工取卵或幼虫盛发期人工捕捉。
五、大蓑蛾
1、危害特征
大蓑蛾又称大袋蛾、皮虫、避债蛾、袋袋虫、布袋虫。幼虫以吃叶为主，也可以吃嫩枝和幼果。吃叶子的时候可以咬成孔洞、缺刻，甚至把叶片吃光只剩下枝条，严重影响开花结果和药材生长。8、9月幼虫进入高龄暴食阶段，危害严重。
2、防治方法
人工摘除虫囊，注意保护幼虫盛期90%结晶敌百虫800~1000倍，注意保护幼虫期和蛹期各种寄生性和捕食性天敌鸟类、寄生蜂、寄生蝇等。
六、山茱萸蛀果蛾
1、危害特征
山茱萸蛀果蛾又名石枣虫、萸肉虫、药枣虫。其幼虫在果实中将果肉蛀成纵横虫道，蛀牙的果实中堆满虫粪，其危害随着果实的成熟而恶化。9月下旬-10月上旬，果实成熟为危害高峰期。
2、防治方法
及时清除早期落果，果实成熟时，及时采收，可减少越冬虫口基数，用2.5%敌百虫粉剂处理树干周围的土壤，可以起到杀蛹和入土幼虫的目的。
