鳗鱼常见的疾病包括鳃肾病、肝肾病、赤鳍病、烂鳃病等。鳗鱼得了鳃肾病使用抗菌素药物基本是无效的，在发病初期就需要投入食盐，使池水达到0.4%-0.7%的浓度就有效果，近海灌进海水也是会有效，在并发其他疾病时，应用其他药物来兼治。鳃肾病流行时，可能导致毁灭性死亡。
一、鳃肾病
1、发病症状：腮肾病的外观看不到明显的症状，腮部肿胀，腮呈暗红色，鳃瓣肥厚、黏连，腮叶出血，化验室血浆检查，氯离子明显低于健康鳗鱼。该病流行时，可能导致毁灭性死亡。
2、防治方法：腮肾病使用抗菌素药物基本无效，在发病初期投入食盐，使池水达到0.4%-0.7%浓度有效，近海灌进海水也有效，在并发其他疾病时，应用其他药物兼治。
二、肝肾病
1、发病症状：肝肾病又称爱德华氏病，由爱德华氏菌属细菌引起，发病温度15℃，发病高峰温度25-30℃，是常见病害，且比较严重，病菌侵袭部位为肝、肾，分肝型和肾型两种，白仔、黑仔阶段肾脏型较多，成鳗阶段肝脏型较多，解剖可见肝肿大或溃烂，皮肤、肌肉溃疡穿孔，肾脏明显肿大坚实。
2、防治方法：
（1）白仔驯化阶段应彻底消毒，清洗蚯蚓。
（2）定期用30毫克/升的福尔马林、3-5毫克/升呋喃唑酮药浴。
（3）白仔阶段可降温到25℃以下，尽量转投配合饲料。
（4）用抗菌素拌饵料喂食，每吨鳗鱼30-50克，喂食5-7天。
（5）大蒜素、氟哌酸以每千克食物3~5克药饵喂食，连续5~7天。
三、赤鳍病
1、发病症状：赤鳍病是由嗜水气单胞菌和斑点气单胞菌引起的，病鳗皮肤、鳍充血、出血，明显变红，严重时会溃烂，肝、脾肿大，死亡率高，一年四季发生，其中春夏季节严重，鳗种及成鳗多发生。
2、防治方法：
（1）清理池塘时，彻底清除池底污泥，用30%-40%的石灰水全面洒在池底、池墙上，或用2毫克/升的漂白粉浸洗池塘5-7小时。
（2）鳗种转池投入前用3%-5%的盐水浸泡10-15分钟，或用5-6毫克/升呋喃西林浸泡30分钟以上。
（3）发病的池塘用25-30毫克/升的福尔马林消毒池塘，或者用1-2毫克/升的呋喃剂泼洒消毒。
（4）给鳗鱼口服抗菌素药物。每千克重鱼体用磺胺类药物100毫克（首次加倍），四环素、霉素、氯霉素各20毫克，呋喃剂4毫克，混合饲料喂食，每天1次，连续5-7天。
四、烂鳃病
1、发病症状：烂鳃病由细菌和寄生虫侵入鳃部引起，病鳗外观几乎看不到异常，病鱼离群独游，浮头，打开鳃瓣，鳃丝组织破坏，缺损大，随着病情的发展，用手指轻轻压病鳗鳃部，会有血水黏液流出，贫血，呈白色，肝脏变黄白色，多发生于高温时期 ，主要危害成鳗，鳗种少发生，零星死亡，投料量过多、吃得过饱是该病发生的诱因。
2、防治方法：
（1）防止过度喂食，发病时停喂或少投配合饲料，在有生饵的地方改用生饵饲喂。
（2）使用抗菌素、磺胺类药物、呋喃剂等药物，混合饲料内服，使用量与赤鳍病相同。
（3）用呋喃剂、福尔马林泼洒，用0.8-1毫克/升高锰酸钾泼洒水池或0.5%的盐水洗澡也有一定的疗效。腮边检查发现有线虫和其他寄生虫危害时，应用0.2-0.4毫克/升敌百虫泼洒，每隔2-3天再使用1次，连续2-3次。
