丝瓜与其他蔬菜不一样，它是雌雄异花同株的存在，花冠是黄色的。在第一雌花发生后，多数茎节能发生雌花。丝瓜的雌雄花比例非常悬殊，总状花序上一般只有一朵雌花，而雄花则多达15~20个；雌花开过之后雄花所在的花序部分才开始伸长，随后每天开一朵雄花。

丝瓜和很多瓜亲戚一样，雄花单朵花花期不长，丝瓜的雄花仅仅从清晨开放到中午，开完后即掉落。而雌花却可以一直停留在子房顶端直到果实可以采摘的时候。

丝瓜自从第一朵雄花出现后，每个叶腋都能产生雄花。雄花多而密，花梗长而祖，需要消耗大量的养料，影响雌花的成瓜。

为了减少雄花对养分的消耗，生产上常将雄花摘除。摘雄花要尽早进行，因为摘除时间越早，所消耗的养分越少，若等到花开后再行摘除，便失去了应有的意义。提倡摘雄花并不是把所有的雄花都进行摘掉，要注意留一部分雄花作为授粉花。