沙藏法。选择地势高、背风、避雨处，用细沙铺衬底面，湿度以手捏成团松开即散为宜，并在四周挖好排水沟，码放一层莲藕铺上一层细沙。如此沙、藕相间，叠放5－6层，最上面盖厚约10厘米的湿沙即可。此法一般可保鲜60天左右。另外，也可在室内用砖或木板围成埋藏坑，坑内铺上5厘米厚的湿沙，将挖出带泥的莲藕按顺序排放，然后层藕层沙，码5－6层高，最上面盖厚约5厘米的湿沙即可。
水藏法。将预处理后的莲藕置于非铁质容器中按顺序排好，浸没在浓度为10%－15%的食盐水中，可保鲜5个月以上。因食盐难以渗入莲藕肉组织，既可防腐又能抑酶，贮藏后风味与新鲜时无二。此法简单易行效果好，可保存半年以上，盐水可重复使用。
覆膜保藏法。此法只需在藕表面覆盖塑料薄膜即可保鲜1个月左右。其优点是贮藏量大、操作方便，可防止干瘪；缺点是贮期短，损耗较大，只适于应市时采用。
真空保藏法。一是护色。将处理后的莲藕从分节处分开，将藕段两头的藕节去掉，并用不锈钢刮子刨去莲藕表皮。将去皮后的莲藕浸在0.8%－1.5%的食盐溶液中至莲藕稍发软。二是脱去水分。莲藕内具有多个孔眼，在浸渍保鲜液过程中其孔眼内滞留有较多水分，需用脱水机将明水脱去即可，以防在贮藏过程中包装袋内出现水珠。三是包装、抽真空。包装的作用在于隔绝氧气。因此，应选择阻气性强的食用塑料袋进行包装，每袋可装1.5公斤左右，并抽真空密封。四是贮藏。贮藏应尽可能选阴凉的环境，避免阳光直射。最佳贮藏温度为5℃，在此温度下可保鲜3－4个月。如果在5℃以下长时间贮藏，会使莲藕组织发生软化，甚至形成海绵状而无法食用。我国的南藕北运过程中经常发生这种现象，造成很大的经济损失，因此，在贮运过程中一定要注意温度的控制。
