有机佛手瓜若采取种子繁殖法，在种子催芽后，可以在25℃条件下栽植。首先，施肥整地，每亩施优质腐熟粗肥1万千克，然后做成1米宽的大垄，也可按1米的行距挖宽、深各80厘米的大埯，施足优质粗肥，按1米的株距，将种瓜的瓜蒂端朝上（也即种瓜出芽的一端朝下），将果实的2／3埋在穴内，接着烧水培土即可。为了保湿保温，可覆盖塑料膜，并注意防止膜或膜上的水滴接触种瓜，否则易烂瓜。一般5～8天即可出苗。如果有苗，则按株行距20厘米栽植种瓜，当长出幼苗后，再按一定株行距定植，定植时可一锹一株带土坨移栽。
若采用插条法育苗，可在生长旺盛的植株上，选用15厘米长的老茎，用生根粉蘸根后，按照15厘米的株距、30度角斜插，在地表上留1～2个腋芽。在25℃气温下，保持土壤潮湿，经7～10天即可生根出芽，待长成幼苗时即可移栽。
采用压条法育苗，可在生长旺盛的植株上，选1～3枝粗壮的蔓压到地表，每隔4～5节压一把土，土埋2节，露出2～3节，并注意压条的顶芽不可埋土，以保证枝条正常生长。这样，在保温保湿的情况下，一般经7～10天即可生根。这时可用剪刀在培土的后方位置剪断，使其脱离母体，成为独立的幼小植体，再培养1周左右就可作为幼苗进行移栽。
