菜心的花不能吃原因有很多，菜心开的花会吸引好多昆虫，有些昆虫的会携带毒素而使有毒物质留在花朵上，另外一般的清菜在种植阶段都会喷洒一些农药,菜心的花吸收农药的程度比叶和茎多，菜心的花农药最多。
菜心的花含有很多农药，农药经口、吸呼道或接触而大量进入人体内，在短时间内表现出的急性病理反应为急性中毒。急性中毒往往导致神经麻痹乃至死亡，甚至造成大面积死亡，成为最明显的农药危害。轻者表现为头痛、头昏、恶心、倦怠、腹痛等，重者出现痉挛、呼吸困难、昏迷、大小便失禁，甚至死亡。
长期使用菜心的花可使农药在体内不断蓄积，对人体健康构成潜在威胁，即慢性中毒，可影响神经系统，破坏肝脏功能，造成生理障碍，影响生殖系统，产生畸形怪胎，导致癌症。 一个值得注意的倾向——近年来，癌症的发病率越来越高，且日趋年轻化，这很大程度上与食用受污染蔬菜有关。 孕妇长期食用含有农药的菜心的花，还可能导致胎儿畸形，危害极大。
不能一概而论所有的菜心的花都不能吃，如果能保证菜心在生长过程中没有喷洒农药，或者没有携带毒素的昆虫接触等，菜心的花也是可以食用的。另外如果一定要吃，最好长时间在清水里浸泡，使食物中毒的可能性达到最小。如果还想了解更多，可以到农村创业--菜心频道，查看更多关于菜心的信息。
