亲龟池的消毒除害放养亲龟前必须将亲龟池准备好，土池可直接消毒清塘，若是新建水泥池，清塘前必须注满水浸泡10～30天，在此期间要换水两到三次，降低硅酸盐含量，后再消毒。对于池底淤泥可采用日光暴晒，挖去塘泥再添加新土等办法进行消毒，如果条件不具备，可进行全池消毒。清塘消毒的目的是杀灭池中的各种病原体、敌害生物和野生动物，改良底质，改善水质条件，为亲龟创造一个良好的生活环境。用于消毒清塘的药物很多，但国内外通用的较好的有生石灰和漂白粉消毒。
(1)生石灰消毒
生石灰清塘是国际上通用的最有效的方法。是利用生石灰遇水时发生化学反应，放出大量的热，产生氢氧化钙，在短时间内使水的氢氧根离子浓度迅速达到0.01摩尔/升以上(pH为11以下)，从而杀死病原体、敌害生物和野杂鱼类，还能中和或改变底泥的酸碱度，使池水呈弱碱性反应，提高水的缓冲能力，同时，补充了水中的钙离子，钙是龟生长发育的营养元素，特别是产卵龟不可缺少的营养元素。
生石灰清塘可分干法清塘和带水清塘两种方法。一般采用干法清塘，在水源不便和不易排水的池子才用带水清塘。
干法清塘是先将池水排至5～10厘米深左右，在池边或池角挖几个小坑，将生石灰倒入坑内，加水化开后，不待冷却就向池四周均匀泼洒，边缘和池中心都要泼洒到。为了提高清塘效果，次日可用铁耙将池底淤泥耙动一次，使石灰浆充分与淤泥混合。干法清塘不必将池水完全排干，否则泥鳅等野杂鱼类钻入泥中杀不死。干法清塘生石灰的一般用量是每亩50～75千克，淤泥较厚的池子可相应增加10%的用量。带水清塘是将池水排至1米深左右，在池边或池角放几个容器，将生石灰放入容器中用水融开，不等冷却就向池中均匀泼洒。带水清塘每100平方米水面用生石灰20～25千克。
生石灰清塘药性消失的天数一般为7～10天，晴天消失快，阴天消失慢，干法清塘快，带水清塘慢。在药性消失后放养前还必须试水，就是将少量龟放入池的网箱内养几小时，观察是否有不良反应。
(2)漂白粉清塘
漂白粉清塘的效果与生石灰相同，但药性消失快，3～5天就可放龟，对于急于使用的龟池更为适宜。漂白粉一般含有效氯30%左右，经水解后产生次氯酸和碱性氯化钙，次氯酸立刻放出活性氯和新生态氧，有强烈的杀菌和杀死敌害生物的作用，但它没有生石灰哪种改良水质和底质的作用。
漂白粉清塘也分干法和带水两种。若池水深1米每100平方米用漂白粉2千克，使池水漂白粉的浓度达到20克/立方米;若池水只留5～10厘米深，则每100平方米漂白粉的用量为0.8～1.5千克。漂白粉易受潮分解失效，所以使用前应测定有效氯的含量，如果含量降低则应根据实际有效氯含量推算出漂白粉实际用量。使用前先将漂白粉用水溶解，立即均匀地向全池泼洒。漂白粉清塘的池水要瘦，否则肥水池的消毒效果就会降低。
