排泄系统
蚯蚓的排泄系统主要由许多肾管组成。也是寡毛类氮排泄的主要器官，除前三个体节及最后一体节外，每一体节中都成对、从体腔到每个肾管的内部开口刚好是在隔膜的前面，为一个漏斗形肾小口。肾漏斗开口扁平，为两片唇，即上后唇和下前唇构成。它们通过体表、消化道和肠上排管的开口，将代谢产物直接或间接地以尿液的形式排出体外。同时蚯蚓的黄色细胞、背孔、体壁粘液细胞等也参与了含氮物质的排泄。
不同种类的蚯蚓，其肾管的种类，形状、数量、排泄尿液的途径往往不同。例如参环毛蚓的肾管分隔膜肾管、体壁肾管和咽肾管，再如巨茎环毛蚓具有咽丛生肾管。
神经系统
蚯蚓的神经系统是由中枢神经系统和外并且与身体的各种感觉器官、反应器官组成反射弧。中枢神经系统包括脑、围咽神经、咽下神经节和腹神经索等部分。外周神经系统是由中枢神经系统向外周发出的所有神经，包括全部感觉神经和运动神经。
反射弧是由感觉器官中的感觉神经细胞、感觉神经纤维，腹神经索中的中间神经元，运动神经细胞及其纤维和反应器官构成。这是蚯蚓适应自然界生活的结果。
此外，蚯蚓的神经系统中也有一些分泌细胞，可以分泌激素（即“荷尔蒙”）。蚯蚓的激素是一类比较复杂而具有活性的有机物质，具有生理的调控机能作用殖、再生均有十分重要的影响。
