番茄是全世界广泛种植的蔬菜作物，起源于南美洲的安第斯山脉地带，人类进行了长期的驯化改良。为全面解读番茄育种过程中的代谢变化，课题组对600余份材料进行了代谢组分析。
番茄的味道是重要的驯化性状。野生番茄苦涩难吃，是因为毒性抗营养因子茄碱含量较高。那么，栽培番茄为什么变得好吃了？研究表明，从野生番茄到栽培番茄的育种过程中，茄碱的含量逐渐降低。进一步的遗传分析发现，茄碱的自然变异受到5个主要遗传位点控制，而且这些位点在驯化及改良过程中受到强烈选择。通过两个主效的位点，能够将主要茄碱含量降低80%。
在鲜食番茄中，比起红果，粉果因质地松软、口感细腻受到市民喜爱。课题组通过代谢组分析，揭示了影响番茄果色和口感的物质成分。
据介绍，课题组通过多组学手段对育种过程进行全景式的分析，有助于培育更加美味营养的番茄。美国康奈尔大学詹姆士教授评价，该研究加深了对作物品质化学的科学认识，将推动高品质品种培育，最终消费者能够从风味更佳、营养更好的食品供应中得利。
