猫屎瓜幼苗出土前或出土后均能受害。未出土的幼苗发病，胚茎和子叶变褐腐烂，幼苗枯死。

幼苗出土后发病，茎基部最初呈水渍状，以后病部变成黄褐色，溢缩成浅状。病情发展很快，常在子叶尚未凋萎前，幼苗就折倒贴伏于地面，但幼苗仍呈青绿色，故称为猝倒。

在低温高湿时，寄主病残体表面及其附近的土壤上，常长出一层白色棉絮状菌丝。在苗床中，开始时只见个别幼苗发病，几天以后即以此为中心向周围蔓延扩展，最后引起成片幼苗猝倒。

猫屎瓜猝倒病的病原为鞭毛菌亚门腐霉菌属中的瓜果腐霉菌。菌丝体发达、多分枝、无色无隔膜。孢囊梗分化不明显，孢子囊顶生或尖生，成膨大的管状，有的具裂瓣状分枝。游动孢子双鞭毛，肾形，在水中作短时游动后即变成圆形的休止孢子，以后萌发成芽管侵入寄生。