在危害香菇生长的所有杂菌中，木霉威胁最大。木霉又称为绿霉菌，广泛分布于各种植物残体、土壤和空气中。据中国农药第一网了解木霉靠孢子传播，常借助气流、水滴、昆虫、原料、工具及操作人员的手、衣服等为媒介，侵入培养基内，一旦条件适宜就萌发繁殖为害。木霉适应性强，繁殖速度快，它本身能分泌毒素，抑制香菇菌丝生长;木霉还能生长在生长势减弱的香菇菌丝体上，使香菇组织细胞溶解死亡。当生产环境不清洁、培养料灭菌不彻底、接种操作不严格，且处于高温高湿条件时，就给木霉侵染造成良机，尤其是多年的菇场和老菇棚，常是木霉猖獗为害的场所。
木霉至今没有理想的根治性药物。因此，创造适合香菇菌丝生长而不利于木霉繁殖的生态环境，是控制危害的根本措施。一旦发生木霉为害，要立即通风降湿，以抑制木霉菌的扩展，处于发菌阶段的培养料感病以后，可采用注射药液的方法抑制木霉扩张，常用的农药药液有石碳酸、甲醛、多菌灵、甲基托布津、石灰水，此外，往污染处撒白灰面，防治效果也很好。
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