绿头野鸭的抗病能力比家鸭强，一般成年鸭较少患病，但育雏期对温度、饲料品质和营养水平的要求较严，很少因传染性疾病而死亡。因饲养管理不当使雏鸭患病死亡，则是雏鸭死亡的主要原因。冬季和早春气温低，育雏管理如不注意保温，则鸭雏易扎堆或受寒拉稀，感染肺炎并造成死亡。霉变饲料易引起绿头野鸭霉菌中毒，其死亡率高于北京鸭与绍鸭。因此，野鸭饲料必须新鲜。
虽然绿头野鸭抗病力强于家鸭，疾病较少，但在人工驯养及常与其他禽类接触的条件下也可感染不少禽类疾病。常可发生的疾病有鸭瘟、鸭病毒性肝炎、禽流感、禽霍乱、鸭疫巴氏杆菌病、大肠杆菌病、沙门氏菌病、禽丹毒、衣原体、绦虫病与棘头虫病等。现介绍部分常见疫病及防治方法：
野鸭瘟
病原 野鸭瘟又称病毒性肠炎，是野鸭瘟病毒引起游禽类候鸟的急性败血性传染病，绿头野野鸭易感染发病。本病可全年发生，但夏秋季多发。幼野鸭、成野鸭均可感染，种野鸭发病死亡率高。病原存在于病野鸭及带毒野鸭分泌排泄物中，可通过消化道、呼吸道、交配、伤口与吸血昆虫等多种途径传播。
症状 潜伏期2天～5天。病野鸭精神沉郁，厌食或绝食，腿麻痹无力，严重腹泻，拉绿色稀粪。鼻流黏液，呼吸困难，眼流浆液性或黏液浓性液体，结膜出血有小溃疡。部分病野鸭头颈肿胀。病程2天～10天。
病变 头颈皮下水肿，皮肤出血，体内黏膜浆膜及多处器官出血。肝、脾脏肿大出血及灰黄小坏死灶。特征病变为口腔、食道及泄殖腔黏膜坏死，形成灰白色或黄褐色痂。肠黏膜出血及小坏死灶，小肠环状带出血，肿胀及表面坏死。
防治 在疫区，每年用野鸭瘟弱毒苗对野鸭群定期接种，可预防本病。20日龄雏野鸭或成年野鸭用苗后免疫期可达半年。发病后野鸭瘟弱毒苗全群紧急接种也可控制疫情。病野鸭用野鸭瘟血清0．5毫升／只肌注，有一定疗效。同时作好野鸭场消毒及病死野鸭处理。
病毒性肝炎
病原 是野鸭肝炎病毒引起雏野鸭发生的一种传染病。本病主要发生于5日龄～10日龄雏野鸭。在孵化季节，可在雏野鸭中很快传播，常经消化道、呼吸道感染。
症状 潜伏期1天～4天，突然发病，病程短促。病初精神委顿，不能随群走动，不食，眼半闭呈昏睡状态，有的腹泻。随后病野鸭出现神经症状，不安，运动失调，身体倒向一侧，两脚发生痉挛，数小时后死亡。死前头向后弯，呈角弓反张姿态。
病变 肝脏肿大柔软，外观呈淡红色或花斑状，表面有出血点或出血斑。胆囊肿大，充满胆汁。脾脏有时肿大，外观有花斑。多数野鸭肾脏充血，肿胀。其他脏器无明显变化。
防治 本病尚无治疗药物。发病后可用高免血清或康复后野鸭的血清进行早期治疗（0．5毫升／只，肌肉注射），可减少死亡和阻止疫病的扩散。另外在收集种蛋前2周～4周，给产蛋雌野鸭肌肉注射弱毒野鸭肝炎疫苗，可通过卵黄将母源抗体传递给雏野鸭，使其在15天内具有一定的抗病能力。对无母源抗体的雏野鸭也可直接注射弱毒野鸭肝炎疫苗。
野鸭疫巴氏杆菌病
病原 本病又称野鸭传染性浆膜炎，由野鸭疫巴氏杆菌引起，主要感染家野鸭，野野鸭亦有易感性。1周龄～8周龄雏野鸭易感染发病，恶劣环境及大肠杆菌等并发病可促进发病，死亡率20％～75％不等。
症状 急性病野鸭眼鼻分泌物增多，咳嗽与喷嚏，腹泻及运动失调，病程2天～3天。慢性者拉稀，消瘦，步态不稳。部分病野鸭有神经症状。
病变 特征性病变为心包、肝周及气囊附着灰白色纤维素。脾脏肿大，充血斑。有时见鼻窦内黏液浓性渗出物。
防治 氯霉素每千克0．4克～0．6克或每千克0．6克～0．8克土霉素，拌料投药3天～5天，配合使用B族维生素有较好的效果。根据用药效果，交替使用庆大霉素、新生霉素及林肯霉素亦能显著降低死亡率。
平时应加强野鸭舍通风、干燥、防寒及清洁卫生工作。野鸭疫巴氏杆菌灭活苗或与大肠杆菌混合灭活苗接种7日龄～10日龄雏野鸭，可预防本病。
野鸭霍乱
病原 野鸭霍乱也叫野鸭出血性败血病、野鸭巴氏杆菌病。是由禽型巴氏杆菌引起的对野鸭危害极大的传染病。成年野野鸭较易感染发病，死亡率很高。
症状 急性型野鸭群突然死亡；亚急性型病野鸭精神不振，体温升高，不食，爱喝水，不喜欢活动，呼吸加快，下痢，拉绿色或白色稀粪，发病快，死亡率高；慢性型病野鸭关节水肿，跛行，常见咳嗽。
病变 最急性病例尸体剖检常未见特殊病变。急性病例，可在皮下组织、心冠脂肪、肺、气管、腹腔浆膜发现大小不等的出血点；肠黏膜有程度不同的充血，出血，尤其十二指肠最为严重；肝脏肿大，呈土黄色，表面密布针头大灰黄色坏死点。
防治 加强饲养管理，搞好清洁卫生，发现有病发生，必须封锁，隔离和消毒。发病野鸭群，注射出血性败血症血清。未发病野鸭接种禽霍乱疫苗，1月龄以上野鸭，肌注2毫升。在饲料中加入磺胺噻唑0．5％～1．0％，连续喂几天，同时加喂B族复合维生素，可减少产蛋下降等副作用。每只成野鸭肌注链霉素10万国际单位或青霉素2万国际单位，每天两次，可治疗本病。
曲霉菌病
病原 由烟曲霉菌引起的一种真菌病。发霉饲料、垫草以及霉菌污染的食槽、用具是主要的传染源。野野鸭吃了霉变的饲料，易引起霉菌中毒，死亡率较高，尤其是幼野鸭。
症状 多发生于2周龄内的雏野鸭，病野鸭精神萎靡，闭眼瞌睡，食欲减退或不食，口渴，吞咽困难。病情严重时，呼吸困难，张口呼吸，口鼻有分泌物，后期下痢，消瘦虚弱而死亡。
病变 气管和支气管中有淡黄色渗出物，肺部有小米粒大到绿豆大的黄白色或灰白色结节，较为坚实，内容物呈干酪状，含大量菌丝体。
防治 不喂发霉饲料，食槽、水槽、用具每天洗刷，保持清洁。野鸭舍应通风、清洁、干燥，垫草保持干燥，野鸭舍定期进行消毒。治疗可在饲料中加入制霉菌素，雏野鸭每只每天用量为2毫克～3毫克。
衣原体病
病原 为鹦鹉热衣原体引起的多种禽类接触性传染病。野野鸭也可感染。病原经病野鸭呼吸道及消化道排出，健康野鸭吸入空气中粪尘或飞沫而感染，也可经蛋传播。饲养管理不良，沙门氏菌及野鸭疫巴氏杆菌也可并发感染本病。
症状 幼野鸭精神不振，食欲废绝，眼鼻发炎，呆立颤抖，步态不稳，腹泻衰竭，后期痉挛死亡。
病变 病变类似野鸭疫巴氏杆菌病及大肠杆菌病。气囊、心包、肝、脾脏表面触片，姬姆萨染色镜检，单核细胞浆内见包涵体可以确诊。
防治 氯霉素、金霉素混料投服，可同时控制野鸭疫巴氏杆菌病及大肠杆菌病。
平时禽舍应防止其他禽类及野鸟进入，加强场地清洁卫生及消毒。
野鸭棘头虫病
病原 是多形棘头虫寄生于野鸭科禽类肠道而引起的寄生虫病。绿头野野鸭易感染，幼野鸭危害严重，死亡率高于成野鸭。棘头虫常以几种淡水虾类为中间宿主，野鸭吞食含有感染性幼虫的虾类而发病。感染季节多为7月～8月。
症状 幼野鸭严重时表现为贫血、衰竭与死亡。成野鸭多无明显症状。
病变 小肠内寄生的虫体呈橘红色，长几毫米至14毫米，肠有黏膜出血与溃疡，浆膜增生小结节。
防治 可用硝硫氰醚，每千克体重每次100毫克～125毫克投服，或用四氯化碳，每千克体重0．5毫克～2毫克1次嗉囊投入。
平时应每年干塘，消灭中间宿主，定期驱虫及加强野鸭粪处理。
