此外，有机、无公害、绿色以及品牌在不同规模中所占比例均不到10%，鸡蛋行业排名前10家的商品蛋鸡养殖企业养殖量在行业占比不足5%。
《中国畜牧业统计摘要》数据显示，我国蛋鸡养殖主体仍以万只以下的中小规模养殖为主，约占全国蛋鸡总存栏量和全国鸡蛋总产量的63%，“小规模，大群体”的养殖特征仍然比较突出。特别是由于行业集中度低，鸡蛋品牌建设严重滞后，大部分蛋鸡养殖场没有自己的品牌，也未经过相关认证，一定程度上导致了鸡蛋价格波动和订单的不稳定，使得鸡蛋行业从生产到流通环节的交易成本增高，食品安全风险较大。“也就是说，蛋鸡行业正在遭受规模不经济，优质不优价的尴尬。”王忠强说。
面对产能长期过剩、生产成本居高不下、蛋鸡养殖密度高、传染性疾病多、防疫压力大等问题，中国农业大学动物科技学院教授杨宁认为，做强蛋鸡产业，首先要发展标准化规模养殖，由分散的小规模生产向标准化规模化转变。其次，要加强研发，保证育种产品多样化，做好种鸡的疾病净化工作，实行精准饲养并优化饲料配方等都是好的解决方法。
近年来，我国非常重视畜牧业环境保护问题，消费者对“舌尖上的安全”也更加看重。随着蛋品下游行业及蛋品加工技术的发展，也迫切要求上游产业加大投入力度，提高蛋品深加工率，开发研制高附加值的绿色蛋类食品，以满足消费者需求。农业部畜牧业司行业监测分析处处长辛国昌认为，政府要加强预警信息发布工作。既要注重保护环境，又要让企业盈利创收，畜禽产业急需实行供给侧结构性改革，这需要政府、行业协会和企业三方合力推动。
