主要通过菌种传播，水，土壤，品种等。
水稻稻瘟病的传播途径
病菌以分生孢子和菌丝体在稻草和稻谷上越冬。翌年产生分生孢子借风雨传播到稻株上，萌发侵入寄主向邻近细胞扩展发病，形成中心病株。病部形成的分生孢子，借风雨传播进行再侵染。播种带菌种子可引起苗瘟。适温高湿，有雨、雾、露存在条件下有利于发病。
稻瘟病最合适的温度是27℃左右，由当年的病菌寄宿在稻草上，这些病菌在干燥的情况下能存活一年以上，在第二年天气暖和后的7月份通过气流传播，落在新的水稻苗上，从而再次引发稻瘟。
品种的抗性因地区、季节、种植年限、生理小种而异。籼稻品种一般比粳稻品种好。同一品种在不同生长阶段的抗性表现也不同。幼苗在4叶期、分蘖期和抽穗期易感病害，圆秆期病害轻，而同一器官或组织在幼嫩期病害重。穗初期抗病能力弱。过量施用氮肥对病害有利。早期或长期深灌导致根系发育不良，抗病能力弱，病情严重。
水稻稻瘟病的预防
预防途径：选优质抗性强的种子来培育，提高抗病能力。施肥要适当，不能过量使用氮肥，过量使用氮肥会使抽穗不整齐，植株抗病能力减弱，有利于病害蔓延。做到早插秧，秧苗间隔合理，保证水稻之间日照足能通风，提高水稻的抗病能力。同时可以用药物（比如春雷霉素）或者米醋对水稻稻瘟进行防治。
气候是稻瘟发生的重要因素，雨水多湿度大日照少有利于稻瘟的发生，一定要及时注意灾害性天气监测，喷洒农药时要选在天气晴朗的日子，不能喷药后遇到降雨，导致药液流失，得不到及时的控制病菌，若药液被雨水冲洗后等天晴一定要记得补喷。
