皋兰县发展白兰瓜、西瓜产业工作取得了一定的成绩，但也存在一些制约产业进一步发展壮大的突出问题：
一是种植结构不尽合理，经济效益不高。由于结构性、季节性、地域性种植结构不合理，导致大部分白兰瓜、西瓜集中上市，造成短时间内市场饱和，供大于求，价格下降。特别是交通不便和信息不畅的种植区更容易出现卖瓜难现象，瓜贱伤农事件时有发生，一定程度上影响了白兰瓜农的积极性。
二是病虫害比较严重，生产成本趋于增加。由于连年种植，尤其是日光温室和高架大棚栽培，病虫害发生频繁，防治成本增加，若管理措施不当，易造成大幅减产或绝收。三是质量保障体系健全。由于标准化建设刚刚起步，各项制度还不健全，标准化技术规程还不完善，使白兰瓜品质和质量难以完全保障。尤其是农药的使用，影响了白兰瓜的品质和质量。四是白兰瓜包装尚未完全统一，品牌优势未能充分发挥出来。五是农民科技素质较低。目前，白兰瓜、西瓜生产仍以一家一户的经营模式为主，缺乏有效的组织、协调和管理，生产上有较大的盲目性。白兰瓜农在新品种引进、新技术应用、市场营销等方面都与市场需求存在一定差距。部分瓜农盲目追求短期经济效益，使用催熟剂，缺乏可持续发展的重要理念。
