娃娃鱼喜洁怕脏，对所处环境水质要求非常严格。野生娃娃鱼一般在栖息在自然植被好、环境无污染，人类较少涉足的深山峡谷溪河中。山区人工养殖娃娃鱼，水源最好选择有常年流水的小溪沟、泉水，也可利用水质清新的大中型水库的底层水,总之水质要清新、鲜活、无污染，溶氧量高，PH值呈中性。从山区农田、矿山流出来的水以及城市自来水，部分化学物质可能超标，不能作为娃娃鱼的养殖用水。