种蝇要放在蝇房饲养。种蝇房的大小，根据需要建造，也可用旧房改装，门和窗安装玻璃和纱窗，以利调温，壁上安装风扇，以调节空气。房内宜有加温设备，使冬天温度保持20-23℃，房内相对湿度保持60%-70%。通道上安装黑布帘，防止种蝇外逃。房内设饲养架，采用大笼饲养，一般设上、下两层。饲养架用角铁或木料做成。每层架放置用尼龙纱网制成的蝇笼，笼长120-200厘米，高80-100厘米，宽度50-60厘米。将种蝇关在笼内饲养内饲养，每笼养种蝇2-3万只，每一个笼子都加上两个布袖，以便加料、加水和采卵，3万只成蝇每天喂奶粉50克，饲料放在有海绵的料盆中，让成蝇站立在海绵上吸食。饲料和水每天换一次。水盆放入海绵，产卵缸内放入湿麦麸供蝇种产卵，每天在种蝇笼取卵一次，送到蛆房育蛆。种蝇产卵以每天上午8时至下午3时数量最多，取卵时间要适当。每批种蝇饲养15-20天即行淘汰，用热水或蒸汽将其杀死，烘干磨粉作畜禽饲料，然后重新换上一批。
在生产蝇蛆的同时，蝇蛆化蛹，作为新蝇种的有二种方法：一是让其自然化蛹，用水洗出蝇蛹;另一种是当养到约5-6天变黄时，将蝇蛆取出放到装有干粉的容器中，促使化蛹。
