生物菌肥是以微生物的生命活动导致作物得到特定肥料效应的一种制品,是农业生产中使用肥料的一种。生物菌肥是活体肥料,它的作用主要靠它含有的大量有益微生物的生命活动来完成。
只有当这些有益微生物处于旺盛的繁殖和新陈代谢的情况下,物质转化和有益代谢产物才能不断形成。因此,生物菌肥中有益微生物的种类、生命活动是否旺盛是其有效性的基础,而不像其它肥料是以氮、磷、钾等主要元素的形式和多少为基础。
微生物肥料是含有特定微生物活体的制品,应用于农业生产,通过其中所含微生物的生命活动,增加植物养分的供应量或促进植物生长,提高产量,改善农产品品质及农业生态环境.微生物肥料包括微生物接种剂、复合微生物肥料和生物有机肥。
国家生物菌肥执行标准
微生物接种剂也叫农用微生物菌剂,国家标准（GB 20287-2006）中规定其3中剂型的有效活菌数分别为：液体大于等于2亿/ml,粉剂大于等于2亿/g,颗粒大于等于1亿/g.复合微生物肥料（NY/T 798—2004）要求液体大于等于0.5亿/ml,粉剂大于等于0.2亿/g,颗粒大于等于0.2亿/g。生物有机肥（NY 884-2012）要求有效活菌数大于等于0.2亿/g。
生物菌肥国家标准中规定，粉剂有效活菌含量大于等于2亿/克；颗粒剂大于等于1亿/克。杂菌含量低于10%(液体)、20%(粉剂)、30%(颗粒剂)。对其他成分(比如有机质和氮磷钾等)没有要求。微生物菌剂和生物有机肥从标准含量都不一样，严格说微生物菌剂更加高级一些。
菌肥一般配合有机肥用在底肥上，微生物菌剂一般可以全部水溶，苗期或者中后期可以冲施，两者对改良土壤都有作用。
