目前仅发现河豚鱼有水霉病和肠炎两种病害。防治河豚鱼的水霉病可用0.3×10-6浓度的孔雀石绿液全池泼洒;防治河豚鱼的肠炎病可用广谱抗菌类药物拌入饲料中投喂。