果子狸选配是配种的前奏，以巩固和提高双亲的优良品质，有目的、有计划地培育新的有益性状，达到获得理想后代的目的。选配通常从双亲主要性状的品质、亲缘关系、年龄和体型等几方面进行考虑。选配又分品质选配、亲缘选配、年龄选配和体型选配四种：
一、品质选配 包括同质选配和异质选配。同质选配主要选择性状优点相同的公母狸交配，目的在于使其后代巩固并发展这些优良品质。同质选配时，在主要性状上，公狸的表现型值相对来说必须高于母狸的表现型值。异质选配主要选择遗传性状优点不相同的公母狸交配，目的在于使其后代能获得兼有双亲不同的优良性状，或者结合双亲的优点培育出新的品种或品系。
二、亲缘选配 主要为了避免近交，近交对遗传力较低的性状有不良影响，一些有害的稳性基因，因近交而达到纯合，从而使生长发育受阻，出现生存力下降等现象。
三、年龄选配 种狸的年龄选配对生产效果有一定影响。一般3～6岁种狸的遗传性能比较稳定，选配效果较好。通常以幼公狸配成母狸、成公狸配幼母狸或成公狸配成母狸生产效果较好。
四、体型选配 应以大型公狸与大或中型母狸交配，中型公狸与小型母狸交配，决不可采取大公狸配小母狸和小公狸配大母狸以及小公狸配小母狸的做法。在生产中可采用群体交配，其方法是把遗传性状优点相同的母狸归类在一起，选几只适宜的公狸，共同组成一个选配群，在群内可采用随机交配。
