水产苗种的质量，将影响到养殖产量和经济效益。实践证明，即使健康的鱼虾蟹种也难免带有一些病原体，清塘消毒过的池塘，若放养不经过消毒处理的种苗，仍会把病原体带入塘中。为此，苗种下塘前应针对不同的品种、不同的病原体，分别采用不同的药物对苗种进行浸洗消毒方可入塘。现将苗种下塘前的常用消毒方法介绍如下：
一、苗种浸泡剂：本品对海淡水蟹类、鱼类、虾类、贝类、龟、鳖类的病毒病、细菌病、真菌病具有明显的预防作用。每50千克养殖用水，加入本品10毫升，充分搅匀，将苗种放入其中浸泡3～5分钟后，可将药液及苗种一并倒入养殖水体。
二、食盐：鱼虾蟹苗种放养前用2%～5%食盐水浸洗10～20分钟，可杀灭粘细菌、水霉菌及车轮虫等。
三、漂白粉：对细菌、病毒、真菌均有不同程度的杀灭作用，可防治赤皮、烂鳃等细菌性皮肤病。使用方法：每立方米水加入10g漂白粉搅拌均匀，鱼、蟹种放入浸洗约10～15分钟后入塘。
四、高锰酸钾：鱼虾蟹苗种用10～20克/立方米的水溶液浸浴20～30分钟，可杀灭鱼体三代虫、指环虫、车轮虫及虾蟹丝状细菌、弧菌等。
五、敌百虫：鱼种放养前用20～30克/立方米渔用敌百虫溶液浸洗15～20分钟，可杀死三代虫、指环虫、锚头鳋、鲺等寄生虫。
六、硫酸铜：8克/立方米硫酸铜和10克/立方米漂白粉混合液，在水温15℃左右，浸洗鱼体20～30分钟，可防治烂鳃、赤皮、车轮虫、斜管虫、毛管虫等病。
