每年开春后是羊驼饲养中使用疫苗最多的时候，有组织、有计划地进行免疫接种，是预防和控制羊驼养殖中传染病的重要措施之一。目前在国内还没有一个统一的羊驼免疫程序，只能在实践中探索，不断总结经验，制定出适合本地区、本羊驼场具体情况的免疫程序。本文介绍了一些常用疫(菌)苗，可供参考。
1.羊驼痘鸡胚化弱毒疫苗
预防羊驼痘。每年3～4月份接种，免疫期一年。接种时不论羊驼只大小，每只皮内注射疫苗0.5毫升。
2.羊驼链球菌氢氧化铝菌苗
预防羊驼链球菌病。每年的3月、9月各接种一次，免疫期半年。接种部位为背部皮下。6月龄以下的羊驼接种量为每只3毫升，6月龄以上的每只5毫升。
3.羊驼四联苗或五联苗
羊驼四联苗即快疫、猝狙、肠毒血症、羔羊驼痢疾苗;五联苗即快疫、猝狙、肠毒血症、羔羊驼痢疾、黑疫苗。每年于2月底3月初和9月下旬分2次接种。接种时不论羊驼只大小，每只皮下或肌肉注射5毫升。注射疫苗后14天产生免疫力。
4.羔羊驼痢疾氢氧化铝菌苗
用于怀孕母羊驼，于分娩前20～30天和10～20天时各注射1次，注射部位分别在两后腿皮下，疫苗用量分别为每只2毫升和3毫升，注射后10天产生免疫力。羔羊驼通过吃奶获得被动免疫，免疫期5个月。
5.羊驼传染性胸膜肺炎氢氧化铝菌苗
皮下或肌肉注射，6月龄以下每只3毫升，6月龄以上每只5毫升，免疫期1年。
6.口疮弱毒细胞冻干苗
预防羊驼口疮。每年3月、9月各注射1次，不论羊驼只大小，每只口腔粘膜内注射0.2毫升。
7.羊驼流产衣原体油佐剂卵黄灭活苗
预防羊驼衣原体性流产。在羊驼怀孕前或怀孕后1个月内皮下注射，每只3毫升，免疫期1年。
8.破伤风类菌苗
预防破伤风。免疫时间在怀孕母羊驼产前1个月，羔羊驼育肥阉割前1个月或羊驼只受伤时，一般在每只羊驼颈部中间1/3处皮下注射0.5毫升，1个月后产生免疫力，免疫期1年。
9.羔羊驼大肠杆菌疫苗
预防羔羊驼大肠杆菌病。皮下注射，3月龄以上的羔羊驼每只2毫升。注射疫苗后14天产生免疫力。免疫期6个月。
10.炭疽菌苗
预防羊驼炭疽病。每年9月中旬注射1次，不论羊驼只大小，每只皮下注射1ml，14天后产生免疫力。
另外，还可以根据所处疫区、生产需要、疫苗价格等特殊情况，有选择地使用羊驼梭菌多联干粉苗、狂犬病疫苗、布氏杆菌猪型2号弱毒菌苗、破伤风抗毒素、口蹄疫弱毒苗、羊驼黑疫菌苗(预防传染性坏死性肝炎)，以及黑疫快疫二联苗，羊驼三联、四联、五联、六联等品种。
