在以人工饵料为主的情况下，淡水养殖动物只有得到全价配合饵料，才能健康、迅速地生长，蛋白质、糖、脂肪、维生素及矿物质等营养成分缺乏或过高，即营养不良，不仅影响其生长、发育，增加饵料系数，严重时还会引起疾病和死亡。
1.蛋白质不足或过多症 蛋白质是生命的物质基础，是淡水养殖动物不可缺少的组成成分。蛋白质缺乏，不仅影响淡水养殖动物增重，而且还影响其生命活动。如鳗鲡饵料中不含蛋白质时，鱼体明显减重;鲤鱼缺乏蛋白质及维生素时，体质恶化，脊柱弯曲，平衡失调，并严重影响内脏组织。 淡水养殖动物对蛋白质的需要量较高，虾为30%～40%，鱼类为40%～50%，鳖则为43%～55%。如斑点叉尾鲴在密养的情况下，饵料中的蛋白质含量不能低于40%，当饵料中蛋白质含量为25%时，鱼体增重仅为吃饵料中含40%蛋白质鱼体增重的12.8%;当饵料中仅含10%蛋白质时，鱼体失重。鳖饵料中蛋白质含量为43%时，才可满足生长需要。但也不是蛋白质越高越好，蛋白质过高，不仅不经济，而且增重率降低。鳗鲡饵料中蛋白质含量超过43.4%时，、鱼体增重;超过44.5%时，饵料系数增加，鱼的生长和蛋白质积累却几乎不变。 另外，饵料中各种氨基酸比例不当在一定程度上也是有害的。斑点叉尾鮰饵料中的赖氨酸低于1.25%～1.75%时，生长缓慢;虹鳟投喂含13.4%亮氨酸的饵料10～11周后，则出现脊椎侧凸、鳃盖和鳞片畸形等病症。
2.糖类不足或过多症 淡水养殖动物可将碳水化合物、纤维素等糖类作为能量来源。大量研究表明，鱼类饵料中碳水化合物含量应为10%～40%，其中，温水性鱼类饵料中碳水化合物的适宜含量为30%，冷水性鱼类为21%;草鱼饵料中纤维素含量应为10%～20%，青鱼为8%，团头鲂为12%。饵料中糖类含量过高，易引起淡水养殖动物内脏脂肪积累，妨碍正常机能。糖类摄入不足时，饵料利用率降低。糖长期摄入不足，还可引起代谢紊乱，生长速度下降，肌体消瘦。
3.脂肪不足或变质症 淡水养殖动物对脂肪的需求不高，如鱼饵料中脂肪含量为4%～18%，鳖饵料中油脂含量为3%～5%已足以。饵料中脂肪含量过高，可引起淡水养殖动物组织器官脂肪沉积过多，妨碍其生理机能。但饵料中必需脂肪酸缺乏时，可引起生长缓慢、贫血、烂鳍、竖鳞、眼球突出、死亡率增加等症。 脂肪很容易氧化，氧化后产生的醛、酮、酸不仅影响饵料价值，而且对淡水养殖动物有一定的危害性。如鲤鱼摄食氧化脂肪1个月后，患背瘦症，病鱼背部肌肉萎缩、坏死，严重时死亡。鳖投喂变质鱼肉，会出现变性脂肪症，病鳖柔软乳白色的脂肪组织变成较硬的淡黄色或黄褐色，肝脏发黑，骨骼软化;病重者背腹部显著隆起，全身浮肿，最后死亡。
4.维生素缺乏症 一种好的饵料应含有维生素A、D、E、K、B1、B2、B6、B12、C、烟酸、叶酸、泛酸、胆碱、肌醇等。如长期缺乏某种维生素，淡水养殖动物生长缓慢、抵抗力下降，甚至死亡。如鲤鱼饵料缺乏维生素B时，食欲可降低4～5倍;缺乏维生素B6时，可引起痉挛、腹部水肿、眼球突出。鳗鲡缺乏维生素B1、B2及泛酸时，生长缓慢、运动失调、皮肤出血;缺乏维生素B2时，畏光。罗氏沼虾缺乏维生素C时，厌食，活动力降低，创伤愈合缓慢，腹部、头胸甲和附肢的几丁质下面，鳃、前肠及后肠的壁上出现黑斑。
5.矿物质不足症 矿物质不仅是淡水养殖动物的重要组成成分，而且其生理功能是多方面的。倘若缺乏这些物质，就会产生代谢障碍和多种缺乏症。如饵料中缺乏矿物质磷时，鲤鱼头盖骨、鳃盖骨畸形，眼球突出;团头鲂鳃盖骨凹陷、残缺，肋骨畸形。鲤鱼、虹鳟饵料中缺锌时，生长缓慢，皮肤、鳍易发生糜烂，虹鳟还会出现白内障。
