户外的锦鲤池常含有丰富的藻类，无论在池壁或是池水中常常覆盖着一层青苔，藻类的出现就表示水中的营养盐太多了，所以会引起藻类的滋生，这些藻类会将水中的营养盐如硝酸盐类、氨吸收利用，可说是一种有利的植物性过滤系统，同时我们也可以透过这些藻类的变化来得知水质状况，水质清澈、绿藻附生在池壁，表示水质稳定，藻相良好，而且这些绿藻还是锦鲤的大餐。
但如果水质呈现绿色也就是浮游性的藻类大量滋生，表示水中的养份太多了，此时就需多加注意了，慎防水中因溶氧量不足而引起倒藻现象。因为藻类大量死亡，鱼只也会受到波及。水族箱中的藻类则常出现在水草叶面、缸壁、过滤器上，有些是小小的绿点，有些则是一片绿色藻层，最严重的是同毛刷般的黑毛藻，只要一有藻类出现就很难除去，必需勤加换水、加入除藻剂等，经过一段的处理时间，待藻类完全脱落后，水族箱才会恢复旧观。我们将这些会引起藻类滋生的物质称为水中的营养因子，包括有：磷酸盐、硝酸盐等，主要来自饲料的残余及排泄物。每5-7天换水一次的动作，另外定期的水质监测都是防止这些营养因子过高的方法，将硝酸盐浓度维持在5ppm以下，磷酸盐浓度维持在1ppm以下，即可有效防止水中藻类的滋长。
